Ústavy AV ČR se významnou měrou podílejí na vydávání nebo přímo vydávají následující odborné časopisy v režimu Open Access.
Gold Open Access
- Acta geodynamica et geomaterialia – (WoS JCR, Scopus)
- Biologia Plantarum – (WoS JCR, Scopus)
- Bulletin of Geosciences – (WoS JCR, Scopus)
- Ceramics – Silikáty – (WoS JCR, Scopus)
- European Journal of Entomology – (WoS JCR, Scopus)
- Folia Parasitologica – (WoS JCR, Scopus)
- Photosynthetica – (WoS JCR, Scopus)
- Physiological Research – (WoS JCR, Scopus)
Hybridní časopisy s možností publikace článků v OA
- Applications of Mathematics (distributor – Springer) – (WoS JCR, Scopus)
- Czechoslovak Mathematical Journal (distributor – Springer) – (WoS JCR, Scopus)
- Eirene. STUDIA GRAECA ET LATINA – (WoS JCR, Scopus)
- Folia Geobotanica (distributor – Springer) – (WoS JCR, Scopus)
- Folia Microbiologica (distributor – Springer) – (WoS JCR, Scopus)
- Studia geophysica et geodaetica (distributor – Springer) – (WoS JCR, Scopus)
Diamond Open Access
- AITHER. Časopis pro studium řecké a latinské filosofické tradice – (Scopus)
- Archeologické rozhledy – (WoS JCR, Scopus)
- Cornova
- Czech Journal of Contemporary History
- Časopis zdravotnického práva a bioetiky – (Scopus)
- Česká literatura – (WoS JCR, Scopus)
- Československá psychologie – (WoS JCR, Scopus)
- Český lid / Czech Ethnological Journal – (Scopus)
- Filosofický časopis – (WoS JCR, Scopus)
- Gender a výzkum / Gender and Research – (Scopus)
- Geologica Carpathica – (WoS JCR, Scopus)
- Higher Structures
- Informace
- Journal of Vertebrate Biology – (WoS JCR, Scopus)
- Knihy a dějiny – (Scopus)
- Mathematica Bohemica – (WoS JCR, Scopus)
- Mediaevalia Historica Bohemica – (Scopus)
- Organon F (Vydavatel’stvo Slovenskej Akademie Vied Veda) – (WoS JCR, Scopus)
- Památky archeologické – (WoS JCR, Scopus)
- Přehled výzkumů – (Scopus)
- Sociologický časopis / Czech Sociological Review – (WoS JCR, Scopus)
- Teorie vědy / Theory of Science – (Scopus)
