Elektronický laboratorní deník (ELN) je nástroj, který vědcům pomáhá strukturovat, dokumentovat a popisovat výzkumná data v digitální podobě. Tento druh softwaru nahrazuje papírové i klasické digitální zápisníky. ELN je užitečný nejen pro ty, kteří provádějí laboratorní experimenty, ale i pro všechny, kteří shromažďují a analyzují data. Ve skupinových projektech umožňuje jasně zaznamenat, kdo byl zodpovědný za konkrétní část experimentu.
Tento nástroj podporuje naplnění FAIR principů v rámci politiky Open Science, a to z hlediska otevřenosti, transparentnosti, dohledatelnosti a reprodukovatelnosti výzkumu a výzkumných dat.
Akademie Věd vydala v roce 2023 oficiální dokument „Doporučení pro vedení laboratorních deníků z pohledu ochrany duševního vlastnictví.“ Najdete ho zde i s dalšími tipy pro jejich využívání.
Novinkami a funkcemi ELN se více zabývá Mgr. Cebecauer Marek Ph.D. z Ústavu fyzikální chemie J. Heyrovského. Ten sepsal porovnání ELN nástrojů, které můžete najít zde. Pokud byste měli zájem o schůzku s ním ohledně ELN, ozvěte se mu na adrese: marek.cebecauer(at)jh-inst.cas.cz.
Výhody ELN
ELN je užitečný zejména v průběhu aktivní fáze správy výzkumných dat a pomůže vám sledovat celý proces výzkumu a jeho výsledky. Tyto nástroje umožňují data shromažďovat v přehledné dokumentaci, mají pokročilé funkce a možnosti vyhledávání v souborech (protokoly, poznámky, šablony).
- Duševní vlastnictví
ELN dokumentuje vaše původní myšlenky a objevy. Pokud se rozhodnete svou práci patentovat, nebo řešíte spory o autorství, ELN vám pomůže, jakožto důkazní materiál a právní záznam Vaší činnosti, prokázat, že jste byli prvním autorem daného nápadu.
- Spolupráce
Pokud v laboratoři pracujete s ostatními, ELN zajistí, že všichni mají stejný přehled o postupu. Díky jeho využívání můžete předejít případným nedorozuměním a chybám.
- Reprodukovatelnost
V případě, že někdo jiný bude chtít váš experiment zopakovat, může se řídit vaším laboratorním zápisníkem jako návodem.
- Zabezpečení dat
ELN nabízejí cloudové zálohování dat, které zabraňuje jejich ztrátě a umožňuje přístup odkudkoli.
- Archivace dat
ELN lze integrovat s dalšími softwarovými nástroji, což může významně usnadnit přenos dat, jelikož přímé importování dat z přístrojů do ELN je bezpečnější a spolehlivější než ruční přepisování. Integrace s dalšími aplikacemi podporuje celý výzkumný proces, včetně DMP a archivačních služeb. Vaše data jsou na jednom místě a lze je z ELN publikovat do repozitářů, a tím je i přesouvat k dlouhodobé archivaci.
Nevýhody ELN
- ELN mohou být zdarma, ale některé jsou placené, či mohou mít omezení na úložišti, velikosti souborů nebo v počtu uživatelů v rámci základní neplacené verze.
- Přestože je výpadek sítě vzácný, může způsobit zpoždění při stahování a prohlížení.
- Některé produkty vyžadují dodatečné školení, a tak je jejich využívání zprvu časově náročné.
Jak si vybrat ELN
Existuje mnoho různých ELN, které mohou nabízet celou řadu funkcí a lze je přizpůsobovat specifickým potřebám. Na trhu je hodně poskytovatelů ELN – některé nástroje jsou zdarma, jiné jsou zpoplatněné, nebo nabízejí základní verzi zdarma s placenými doplňky.
Pro jejich porovnání a výběr jsou zde užitečné zdroje:
- How to pick an electronic laboratory notebook
- 2019 Review of the Best Electronic Laboratory Notebooks
- Guide on choosing an ELN from Simon Bungers of Labfolder.
- Electronic Lab Notebook Comparison Matrix
- Considerations for implementing electronic laboratory notebooks in an academic research environment
- ELN finder je nástrojem pro výběr vhodného ELN dle Vašich potřeb
- https://datamaterialized.eu/elab-notebooks.html porovnání ELN od Mgr. Cebecauer Marka Ph.D dle kritérií: User-friendly, FAIR data, a funkcí
- článek s dvaceti nejlepšími ELN z roku 2024 najdete zde
Seznam hojně používaných ELN
| ELN | Odkaz | Free of charge |
| eLabFTW | https://www.elabftw.net/ | Ano |
| Kadi4mat | https://kadi.iam.kit.edu/ | Ano |
| LabArchives | https://www.labarchives.com/ | Ne |
| Labfolder ELN | https://www.labfolder.com/ | Freemium* |
| LabLog™ Electronic Lab Notebook (ELN) | https://labnotebook.app/ | Ne |
| Labstep | https://www.labstep.com/ | Ano |
| LabWare ELN | https://www.labware.com/lims/electronic-lab-notebook | Ne |
| Mbook – Mestrelab | https://mestrelab.com/software/mbook/ | Ne |
| openBIS | https://openbis.ch/ | Ano |
| Open WetWare | https://openwetware.org/wiki/Main_Page | Ano |
| OSF | https://osf.io/ | Ano |
| Rspace | https://www.researchspace.com/ | Freemium* |
| Scilligence – Software Solutions for Life Science R&D | https://scilligence.com/scilligence-eln/ | Ne |
Zpracováno podle:
Esther Plomp (2019) „Electronic Lab Notebooks: turning a new page in laboratory research“;
NTK kurz Data Steward od DocEnhance;
eLab Notebooks porovnání ELN od Mgr. Marka Cebecauera Ph.D., online 2. 9. 2024;
The Pros and Cons of Using an Electronic Lab Notebook (ELN) od Rebecca Talley, online 2. 9. 2024
Electronic Lab Notebooks od Book The Turing Way, online 2. 9. 2024 ;
Advantages and Benefits of Using an Electronic Lab Notebook by Rick Halton, online 2. 9. 2024
