Švýcarský institut bioinformatiky (SIB) pořádá 8. července 2025 praktický jednodenní online kurz zaměřený na to, jak mohou vědci v oblasti biologických věd učinit svůj výzkum více FAIR – tedy Findable, Accessible, Interoperable a Reusable (dohledatelný, přístupný, interoperabilní a znovu použitelný). Webinář s názvem Reusable Analysis: Make Your Research FAIRer with Quarto, GitHub and Zenodo nabídne praktický úvod do nástrojů podporujících otevřenou a reprodukovatelnou vědu.

Účastníci se naučí:

• vytvářet sdílené, dobře zdokumentované zápisníky pomocí Quarta – publikačního systému založeného na Markdownu,
• sledovat a verzovat svou práci pomocí Gitu (verzovacího systému) a GitHubu (platformy pro hostování a spolupráci na kódu),
• publikovat webové stránky pomocí GitHub Pages,
• archivovat výsledky v Zenodu – open-access repozitáři, který přiděluje výzkumným výstupům DOI.

Tyto dovednosti pomáhají zajistit, že výzkumné pracovní postupy budou transparentní, sdílené a dlouhodobě přístupné. Kurz je určen pro výpočetní biology, bioinformatiky a další vědce v oblasti biologických věd se základní znalostí R nebo Pythonu. Podmínkou účasti je účet na GitHubu a předem nainstalované nástroje (R, RStudio nebo VSCode a Quarto).

Registrace je otevřena do 30. června 2025 nebo do naplnění kapacity. Poplatek činí 100 CHF pro akademické pracovníky a 500 CHF pro účastníky z komerční sféry.

Podrobnosti a registrace jsou dostupné zde, další informace naleznete také zde.

O SIB

SIB (Swiss Institute of Bioinformatics) je nezisková organizace a jeden z největších národních uzlů infrastruktury ELIXIR, která propojuje databáze, nástroje a repozitáře pro podporu výzkumu a inovací v oblasti biologických věd napříč Evropou. SIB vyvíjí a spravuje více než 160 open-access bioinformatických zdrojů a hraje klíčovou roli ve školení, koordinaci dat a zavádění FAIR principů v rámci evropského výzkumného prostoru.

Aktualizováno dne 17 června, 2025