Kurzy v EMBL-EBI

EMBL-EBI je jedním ze šesti pracovišť Evropské laboratoře molekulární biologie (EMBL), mezivládní výzkumné organizace financované více než 20 členskými státy, perspektivními a přidruženými členskými státy. Tato výzkumná organizace je tvořena zkušenými odborníky, kteří sdílí zálibu ke školení ve všech jeho formách. Jejich cílem je vytvořit program, který umožní vědcům na všech úrovních plně využívat veřejná biodata a otevřeně sdílet své odborné znalosti s ostatními bez ohledu na místo, odvětví či kariérní stupeň. Přehledný seznam jejich aktivit najdete na jejich webových stránkách pod sekcí vzdělávání.

Další kurzy vzdělávání poskytuje například TeSS platforma, která byla vyvinuta skrze Elixir s cílem nabídnout jednotné místo pro vyhledávání informací a obsahu online. Tento obsah pak zahrnuje školící materiály, události a interaktivní výukové programy, kurzy, akce, videa, prezentace, vzdělávací cesty, příručky atd.

Kurz “Data science for life scientists”

Kdy: 16.-20. června 2025

Uzávěrka přihlášek: 2. března 2025!

Kde: European Bioinformatics Institute, Spojené království

Tento kurz seznámí vědce z oblasti přírodních věd s praktickými tématy vědy o datech používanými v přírodních vědách, jako je vizualizace dat, analýza obrazu, použití umělé inteligence a využívání veřejně dostupných databází.

Program

Na začátku kurzu se seznámíte s teorií a praxí vědy o datech, včetně osvědčených postupů pro provádění analýz, správy dat a reprodukovatelnosti. Kurz poskytne praktický výcvik v nástrojích a zdrojích vhodných pro váš výzkum, včetně seznámení s používáním jazyka Python pro zpracování a vizualizaci dat, statistickou analýzu a aplikaci strojového učení.

Součástí tohoto kurzu jsou skupinové projekty s dvěma různými tématy (exprese genů a struktura proteinů), v rámci kterých budete rozděleni do malých skupin.

Tento kurz je vhodný zejména pro uchazeče, kteří jsou v rané fázi využívání vědy o datech ve svém výzkumu a mají potřebu dále rozvíjet své znalosti a dovednosti. Týká se to například doktorandů, kteří jsou připraveni začít analyzovat vlastní data. Pro tento kurz nejsou vyžadovány žádné zvláštní znalosti programování, účastníci však budou požádáni, aby absolvovali některé předkurzy. Pro začátek výuky jazyka Python doporučují tento bezplatný výukový kurz.

Přihlášení

Více info o kurzu  a přihlášení se na něj naleznete na jejich webových stránkách zde.

Kurz “Data visualisation for biology”

Kdy: 24. – 26. června 2025 

Uzávěrka přihlášek: 9. března 2025!

Kde: European Bioinformatics Institute, Spojené království

Program

Tento kurz poskytne vhled a praktické zkušenosti s vizualizací dat pro zkoumání komplexních a vícerozměrných biologických dat. Kurz se zaměří spíše na práci s omickými (např. genomickými, transkriptomickými) daty než například se zobrazovacími daty.

Tento kurz je určen zejména biologům a bioinformatikům, kteří chtějí zkoumat svá vlastní komplexní data, aby získali vhled do problematiky a rozvíjeli nové hypotézy. Dále je vhodný i pro ty, jejichž cílem je efektivně sdělovat svá zjištění pomocí vizualizace, ať už v publikacích, na konferencích nebo prostřednictvím nástrojů pro zkoumání dat určených pro ostatní. Předchozí zkušenosti s programováním nejsou striktně vyžadovány, ale během semináře se pracuje v jazyce R nebo Python. Proto jsou doporučené pro uchazeče tyto bezplatné výukové materiály:

• Úvod do prostředí Unix – https://swcarpentry.github.io/shell-novice/index.html
• Úvod do jazyka R – https://swcarpentry.github.io/r-novice-inflammation/
• Úvod do jazyka Python – http://swcarpentry.github.io/python-novice-gapminder/

Uchazeči budou v rámci přihlašovacího procesu požádáni, aby podrobně popsali svou úroveň programovacích schopností a znalost vizualizačních nástrojů. Přihlášky budou posuzovány na základě několika faktorů, mezi něž patří i multiplikační efekt žadatele po absolvování kurzu, rozmanitost zastoupených oborů a dostupnost dat.

Přihlášení

Pro více informací ohledně přihlášení se na kurz navštivte jejich webové stránky zde.